Il l’a visitée en qualité de pape lors de ses trois visites de Wadowice : en 1979, 1991, 1999. En 1992, Jean Paul II a élevé l’église de la Présentation de Notre Dame au rang de basilique mineure. Elle comporte quatre chapelles : celle de Sainte-Croix avec le tableau de Notre-Dame de l’Aide Incessante, réalisé à Wadowice et couronné par le pape lors de sa dernière visite ; celle de la Sainte-Famille avec les figures de la Sainte Famille et avec les fonds baptismaux situés au centre, ceux du baptême de Karol Józef Wojtyła le 20 juin 1920 ; celle de la Crucifixion avec, au tabernacle, les reliques des saints : Père Pio, Szymon de Lipnica et Maksymilian Kolbe ; enfin celle de Saint Père Jean Paul II avec, dans l’autel, un reliquaire contenant du sang de Jean Paul II et un effigie du saint patron de la chapelle. L’intérieur abrite une figure de Jean Paul II et le bâton pastoral du pape Benoît XVI, souvenir de son pèlerinage de Wadowice en 2006.